Habilidades ocultas
Usa los siguientes equipos personalizados en el modo Héroes para desbloquear una nueva habilidad. Los personajes pueden seleccionarse en cualquier orden.

Akatsuki: 
Itachi y Kisame.

Association of Ninja Thugs: 
Itachi, Kisame, Orochimaru

Aurora of Legends: 
Orochimaru, Tsunade, Jiraiya

Author & Fan: 
Author y Fan

Eternal Rivals: 
Kakashi y Guy

Hard Work United: 
Lee, Naruto, Hinata

Maestro y aprendiz:
Naruto y Jiraya

Maestro y aprendiz sangriento:
Guy y Lee

Doncellas enamoradas:
Ino, Sakura e Hynata.

Prueba de existencia:
Sasuke, Naruto y Gaara.

Sharingan:
Sasuke, Itachi y Kakashi.

Byakugan: 
Neji e Itana.

El maldito:
Orochimaru y Sasuke

Problema triple:
Naruto, Kiba y Chouji.

Clan Uchiha: 
Sasuke e Itachi

Los miticos Sannin:
Tsunade, Orichimaru y Jiraiya.

Los solitarios:
Sasuke, Naruto y Gaara

Genios:
Sasuke, Neji y Shikamaru

Hidden Spikes Any Team combo

Hot Blood Master & Student Guy y Lee

Indonmitable Guts Points x 2 Naruto y Jiraiya

Maidens In love Ino, Sakura, Hinata

Proof of The Existence Sasuke, Naruto, Gaara

Sharingan to the Max Sasuke, Itachi, Kakashi

Team Byakugan Neji y Hinata

Team Genius Neji, Sasuke, Shikamaru

The Cursed Orochimaru y Sasuke

Triple Trouble Naruto, Kiba, Chouji

Modos y personajes desbloqueables

Hokage (tercero) 
Completa los 30 niveles en Segunda Historia.

Itachi 
Completa los 30 niveles en Segunda Historia.

Jiraiya 
Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Kabuto 
Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Kisame 
Completa los 30 niveles en Segunda Historia.

Orochimaru 
Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Sasuke
 Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Second Story
 Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Shizune
 Completa los 100 niveles en el Modo Historia.

Tsunade 
Completa los 100 niveles en el Modo Historia.